不锈钢巴氏杀菌机工作原理是在一定温度范围内，温度越低，细菌繁殖越慢；温度越高，繁殖越快。但温度太高，细菌就会死亡。不同的细菌有不同的适生长温度和耐热、耐冷能力。巴氏消毒其实就是利用病原体不是很耐热的特点，用适当的温度和保温时间处理，将其全部杀灭。但经巴氏消毒后，仍保留了小部分无害或有益、较耐热的细菌或细菌芽孢，因此巴氏消毒牛奶要在4℃左右的温度下保存，且只能保存3~10天，多16天。
目前市面上使用的巴氏杀菌程序种类繁多。“低温长时间”(LTLT)处理是一个间歇过程，如今只被小型乳品厂用来生产一些奶酪制品。
“高温短时间”(HTST)处理是一个“流动”过程，通常在板式热交换器中进行，如今不锈钢巴氏杀菌机被广泛应用于饮用牛奶的生产。
通过该方式获得的产品不是无菌的，即仍含有微生物，且在储存和处理的过程中需要冷藏。
“快速巴氏杀菌”主要应用于生产酸奶乳制品。
上通用的巴氏高温消毒法主要有两种：
一种是将牛奶加热到62~65℃，保持30分钟。采用这一方法，可杀死牛奶中各种生长型致病菌，灭菌效率可达97.3%~99.9%，
经消毒后残留的只是部分嗜热菌及耐热性菌以及芽孢等，但这些细菌多数是乳酸菌，乳酸菌不但对人无害反而有益健康。
第二种方法将牛奶加热到75~90℃，保温15~16秒，其杀菌时间更短，工作效率更高。但杀菌的基本原则是，能将病原菌杀死即可，温度太高反而会有较多的营养损失。
在使用不锈钢不锈钢巴氏杀菌机前，为了确?；鞯恼Ｔ诵校枰鋈缦碌男阅懿馐裕?/div>
一、首先打开真空泵奶泵循环水泵的冷却水，使冷却水供应充分。
二、检查冷却水水箱，确认水箱中有水。检查真空表是否在零位及各泵接口，四段式杀菌器各接口是否接对，各接口有无松动露气，检查无误后，再进行下一步操作。
三、先不要开泵空泵，用水在四段式杀菌器从闪蒸器间循环待加热温度升起后，可以进料。
四、同时打开四段式杀菌器供料泵及闪蒸器出料泵，使闪蒸器内料液液面保持在视镜中线以下位置，待料液面平稳后，进行下一步工作。
五、打开冷却水循环系统，使冷却水液面保持在冷却水液面保持在冷却器镜中线位置开始循环。
六、开真空泵开泵前，先将真空泵关阀然后逐渐开启让真空泵升高。
七、在真空泵升高过程中，因真空泵影响闪蒸器出料泵，出料呈减小，液面上升必须关小四段式杀菌器进料口，使液面稳定。因此时真空泵不必达到大（0.08）。
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